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大熊貓微生物組 版權信息
- ISBN：9787030789839
- 條形碼：9787030789839 ; 978-7-03-078983-9
- 裝幀：平裝
- 冊數：暫無
- 重量：暫無
- 所屬分類：>>
大熊貓微生物組 內容簡介
腸道微生物組是對消化道內存在所有微生物的統稱，通常被稱為腸道菌群，腸道微生物生態系統是哺乳動物體內*復雜和*特殊的生態系統，同時也是對哺乳動物影響優選的生態系統。越來越多的證據表明，腸道菌群在宿主的消化功能、營養獲取、免疫和代謝中起著重要作用。大熊貓在大約240萬年前從食肉動物轉變為食草動物，雖然現代大熊貓仍然有以肉為食的能力，但在人工飼養條件下的大熊貓和在野外環境下觀察到的野外大熊貓，竹子在它們的飲食中占有99%的比例，大熊貓為了適應竹子這種飲食在其形態、生態、行為和基因方面發生了一系列適應性進化，其中腸道菌群發揮了重要的作用。本書基于項目組長期的研究成果，綜合前人的研究，主要包括以下內容：1）大熊貓的演化、營養與主食竹、消化系統特征等；2）腸道微生物群落結構；3）影響腸道菌群的因素；4）大熊貓腸道微生物的功能；5）大熊貓腸道微生物與疾病；6）大熊貓腸道寄生蟲；7）大熊貓腸道微生物研究方法。人及動物腸道內存在著大量的微生物群落，構成一個龐大且復雜的微生物系統，與宿主的進化、健康、疾病消化等方面息息相關。腸道微生物菌群與宿主形成動態平衡，對機體是有益的，而一旦其平衡被打破，對機體是有害的。大熊貓是我國珍稀物種，腸道內定居著大量微生物，與其消化、生理、健康等有著密切的關系，了解大熊貓腸道微生物結構和組成、功能，有利于更好地、科學地保護大熊貓。
大熊貓微生物組 目錄
目錄**章 大熊貓分布與演化1**節 大熊貓的分布1一、野生大熊貓分布現狀1二、圈養大熊貓數量及分布4第二節 大熊貓的演化與歷史分布7一、大熊貓的演化7二、大熊貓的歷史分布8參考文獻10第二章 大熊貓生活習性與營養11**節 大熊貓的生活習性11一、社會通訊11二、晝夜活動節律12三、生境選擇13四、食性14五、繁殖15第二節 大熊貓食物與營養16一、大熊貓主食竹16二、其他食物27三、營養27參考文獻37附件1 大熊貓的生長發育39第三章 大熊貓生理結構與微生物組43**節 大熊貓呼吸、消化及生殖系統43一、大熊貓形態43二、大熊貓呼吸道器官解剖形態及位置43三、大熊貓上消化道器官解剖形態及位置43四、大熊貓胸腔內器官44五、大熊貓腹腔內器官44六、大熊貓糞便45第二節 大熊貓微生物組48一、腸道微生物與宿主的關系49二、影響腸道微生物的因素50三、高通量測序技術在腸道微生物研究中的應用51四、大熊貓腸道微生物及功能51參考文獻56第四章 大熊貓腸道微生物群落結構60**節 大熊貓腸道細菌種群結構60一、基于可培養技術研究大熊貓腸道細菌群落結構61二、基于免培養技術研究大熊貓腸道細菌群落結構65第二節 大熊貓腸道放線菌種群結構88一、基于可培養技術研究大熊貓腸道放線菌群落結構89二、基于免培養技術研究大熊貓腸道放線菌群落結構90第三節 大熊貓腸道真菌種群結構100一、基于可培養技術研究大熊貓腸道真菌群落結構100二、基于免培養技術研究大熊貓腸道真菌群落結構102第四節 大熊貓腸道病毒108一、大熊貓腸道病毒的流行108二、腸道病毒的培養及生物學特性111三、基于宏基因組測序研究大熊貓腸道病毒112參考文獻115第五章 大熊貓腸道微生物群落的影響因素123**節 年齡對大熊貓腸道微生物的影響123一、成年大熊貓腸道菌群123二、老年大熊貓腸道菌群124三、亞成年、成年和老年大熊貓腸道菌群組成對比126第二節 性別對大熊貓腸道微生物的影響129第三節 地域對大熊貓腸道微生物的影響132一、圈養大熊貓腸道細菌菌群132二、不同地域亞成年大熊貓腸道菌群132三、不同地域成年大熊貓腸道菌群134四、地域對腸道微生物的影響分析134第四節 圈養、培訓與放歸對大熊貓腸道微生物的影響137一、圈養、培訓與放歸及野生大熊貓的腸道細菌菌群138二、圈養、培訓與放歸大熊貓的腸道真菌菌群139三、圈養、培訓與放歸對大熊貓腸道菌群的影響分析141第五節 食性轉換對大熊貓腸道菌群的影響144一、食性轉換中大熊貓腸道細菌菌群的變化145二、食性轉換中大熊貓腸道真菌菌群的變化149三、食性轉換對大熊貓腸道菌群的影響分析152第六節 竹子營養和微生物對圈養大熊貓腸道微生物的影響154一、食用不同竹種的大熊貓腸道細菌菌群154二、食用不同竹種的大熊貓腸道真菌菌群157三、竹營養對大熊貓腸道微生物的影響159四、不同竹種的細菌菌群161五、不同竹種細菌對大熊貓腸道細菌菌群的影響163六、不同竹種的真菌菌群164七、不同竹種真菌對大熊貓腸道真菌菌群的影響166八、竹營養與微生物對大熊貓腸道菌群的影響分析167第七節 野生大熊貓主食竹的營養與微生物組169一、大熊貓主食竹的營養170二、大熊貓主食竹的細菌菌群172三、大熊貓主食竹的真菌菌群175四、基于培養組學的大熊貓主食竹的細菌菌群178五、基于野外調查與分析的大熊貓食用竹的真菌類群191參考文獻195第六章 大熊貓腸道微生物功能203**節 基于可培養技術的微生物功能解析203一、對木質纖維素的降解功能203二、益生功能204第二節 基于宏基因組學的微生物功能解析208一、基于宏基因組測序的基因功能分析208二、基于宏基因組組裝基因組（MAG）的功能注釋分析210第三節 基于宏轉錄組學的微生物功能解析216一、COG、GO功能注釋216二、KEGG功能注釋217三、CAZy功能注釋219第四節 基于宏蛋白質組學的微生物解析功能221第五節 基于代謝組學的微生物功能解析224一、基于非靶向代謝組學的功能解析225二、基于靶向代謝組學的功能解析227三、基于核磁共振代謝組學的功能解析227參考文獻236第七章 大熊貓腸道微生物與疾病240**節 大熊貓腸道致病菌及其生物學特性240一、大腸桿菌240二、肺炎克雷伯菌240三、空腸彎*菌241四、亞利桑那沙門氏菌241五、銅綠假單胞菌241六、小腸結腸炎耶爾森氏菌242七、溶血性鏈球菌242八、不動桿菌242九、毛霉菌243十、白色念珠菌243十一、其他腸道致病菌及其生物學特性243第二節 大熊貓腸道細菌耐藥性244一、細菌的耐藥機制245二、大熊貓腸道細菌的耐藥表型與基因型246三、大熊貓細菌耐藥性的控制策略256第三節 大熊貓腸道細菌毒力與耐藥基因257一、基于宏基因組的毒力基因注釋257二、基于宏轉錄組和宏基因組的耐藥基因注釋258三、基于全基因組的耐藥基因和毒力基因的注釋262第四節 大腸桿菌烈性噬菌體分離與生物學特性研究274一、噬菌體分離純化274二、噬菌體的透射電鏡觀察274三、噬菌體裂解譜測定275四、噬菌體*佳感染復數測定275五、噬菌體一步生長*線測定277六、噬菌體溫度和pH敏感性測定277七、噬菌體氯仿敏感性279八、大腸桿菌噬菌體分析279參考文獻280第八章 大熊貓腸道寄生蟲286**節 寄生蟲分離鑒定及生物學特性286一、大熊貓腸道寄生蟲種類286二、西氏貝蛔蟲286第二節 西氏貝蛔蟲基因組與轉錄組292一、西氏貝蛔蟲基因組292二、西氏貝蛔蟲發育轉錄組296三、西氏貝蛔蟲分泌組300第三節 基于宏基因組學和宏轉錄組學的大熊貓腸道寄生蟲304第四節 寄生蟲的防控308一、治療性驅蟲308二、預防性驅蟲308三、大熊貓糞便的無害化處理308四、重視和不斷改善大熊貓的福利308五、大熊貓寄生蟲藥物防治309參考文獻310第九章 大熊貓生殖道微生物群落結構與功能313**節 基于可培養技術的細菌菌群313第二節 基于16SrRNA高通量測序的細菌種群結構314第三節 基于ITS高通量測序的真菌種群結構318第四節 基于宏基因組的種群結構321參考文獻329第十章 大熊貓口腔微生物331**節 大熊貓口腔微生物群落結構331一、大熊貓口腔細菌333二、大熊貓口腔真菌334三、大熊貓口腔病毒334第二節 大熊貓口腔微生物群落結構的影響因素335一、年齡因素335二、性別因素336三、飲食因素336四、環境因素336五、疾病因素336第三節 大熊貓口腔微生物與健康337一、大熊貓口腔微生物的致病作用337二、大熊貓口腔微生物的益生功能339參考文獻339第十一章 大熊貓體表微生物342**節 大熊貓體表真菌研究現狀342一、大熊貓體表真菌研究概況342二、真菌實驗室鑒定方法342第二節 基于培養的大熊貓被毛可培養真菌346一、大熊貓體表真菌分離鑒定346二、大熊貓體表真菌形態學特征347第三節 基于高通量測序的大熊貓體表微生物菌群多樣性研究371一、大熊貓體表細菌種群結構371二、大熊貓體表真菌種群結構375參考文獻378第十二章 大熊貓微生物組學研究方法382**節 腸道微生物的分離培養及鑒定382一、細菌382二、放線菌383三、真菌385第二節 多組學方法分析腸道微生物391一、糞便預處理392二、基于擴增子研究微生物多樣性392三、基于宏基因組學研究微生物多樣性393四、宏轉錄組396五、宏蛋白質組397六、全基因組399第三節 微生物學特性研究方法401一、木質纖維素降解401二、益生特性402三、致病性405四、耐藥性406參考文獻411
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